1.4. 高级分析系列

1.4.1. chip-seq的结果定量与比较

如何对 chip-seq 的结果定量？ Chip seq的定量与比较（Diffbind）告诉了我们什么信息？

原理概述： 我们是如何计算定量结果与差异Peak的？

分析案例： Chip差异Peak分析结果及报告

1.4.2. RNA-seq 和 Chip-seq 的联合分析

RNA-seq 和 Chip-seq 的联合分析

• 意义在于寻找转录水平变化的根本原因，从表观水平的变化去解释。

• “RNA seq 和 组蛋白Chip 联合分析” 与 “RNA seq 和 转录因子Chip 联合分析” 分析流程相同，不同在于得到结果的意义。

1.4.3. CRC分析

CRC分析能给出什么信息？

• CRC（Core transcription regulatory circuitry ）：核心调控网络分析

• 通过调控网络关系分析，可以从SEs中通过找到的核心影响转录因子。助力精确定位核心转录因子

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• 1 . ChIP-seq
  • 1.1. ChIP-seq可以告诉我们什么信息
  • 1.2. TF-chip与Histonechip
  • 1.3. superenhancer的分析
  • 1.4. 高级分析
• 2 . RNA-seq
  • 2.1. RNA-seq能告诉我们一些什么信息
  • 2.2. mRNA建库，分析
  • 2.3. ncRNA seq
  • 2.4. go与kegg的意义与David网站