2.3. ncRNA seq 流程

2.3.1. ncRNA的建库与分析流程

ncRNA（micRNA lncRNA CIRCRNA）的建库与分析流程如下：

（miRNA 特异链 建库）

• micRNA建库与分析流程

• lncRNA建库与分析流程

• circRNA建库与分析流程

分析案例：

• micRNA测序与分析报告

• lncRNA测序与分析报告

• circRNA测序与分析报告

2.3.2. ncRNA的靶基因寻找方案

我们通过一系列分析筛选到的ncRNA列表后，并不能直接确定它能影响的生物学功能，因此，我们需要通过分析它对应能影响到的靶标基因，通过靶标基因来确定相关生物学功能。

但以上分析得到的ncRNA（micRNA lncRNA CIRCRNA）又如何找到其靶基因？

ncRNA（micRNA，lncRNA，CIRCRNA）靶标基因寻找方法：

• miRNA的靶标基因预测方法

• lncRNA的靶标基因预测方法

• circRNA的靶标基因预测方法

• 1 . ChIP-seq
  • 1.1. ChIP-seq可以告诉我们什么信息
  • 1.2. TF-chip与Histonechip
  • 1.3. superenhancer的分析
  • 1.4. 高级分析
• 2 . RNA-seq
  • 2.1. RNA-seq能告诉我们一些什么信息
  • 2.2. mRNA建库，分析
  • 2.3. ncRNA seq
  • 2.4. go与kegg的意义与David网站