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RIP RNA结合蛋白免疫沉淀技术

 RIP RNA结合蛋白免疫沉淀技术

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation AssayRNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。

RIP原理流程.png

 

在RIP实验过程中我们设置一系列的质控标准以确保每一步实验的真实有效,如WB检测抗体和蛋白的表达,最后产物qTR-PCR检测的跑胶图。具体示例如下图所示:

RIP-WB检测抗体.jpg

WB检测抗体的效果和RNA结合蛋白的表达。

RIP-QPCR跑胶.jpg

 

RIP-qPCR实验后,体系内的RNA反转录片段扩增物进行DNA电泳,检测qPCR扩增产物是否和设计相符,以及检测是否有引物二聚体产生影响实验。

 

 

 

RIP实验结果一般为产物的Q-PCR结果数据或者高通量测序数据,如图为RIP产物的Q-PCR结果示例。

RIP结果.jpg

RIP产物的qPCR 检测结果,从结果可看出EZH2蛋白能与图示的几种RNA结合互作。

 

 


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