所属分类:TF(Histone)- DNA 互作
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ATAC-seq 技术用到了一个转座酶 Tn5:DNA 转座是一种由 DNA 转座酶介导,把 DNA 序列从染色体的一个区域插入到另外一个区域的现象,类似于“剪切粘贴”。这个过程,也是需要插入位点的染色质是开放的,否则就会被一大坨高级结构给卡住。
转座酶可以随机结合并切割染色质开放区的 DNA,并且可同时在切割位点插入接头序列。只要将携带已知 DNA 序列标签的转座复合物(即带红色和蓝色序列标签的 Tn5 转座酶)加入到细胞核中一起孵育,再利用已知序列标签进行 PCR 扩增即可形成文库,经过测序就可以获得染色质开放区的信息。
服务优势:
细胞用量少
实验周期短,1-2天可完成
实验结果重复性高
可同时检测转录因子与核小体的定位
客户提供:
每个样本50000 个细胞
至少两组样品,对照组与实验组
赛诚提供:
原始数据raw data
数据质控结果:raw data-fastqc、clean data-fastqc
call peak 结果文件:bam文件.excel文件.bw文件(IGV可打开文件)
可按客户要求进行定制化分析