所属分类:TF(Histone)- DNA 互作
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CUT&TAG是一项在基因组范围内检测蛋白与DNA互作的新技术,首先将细胞固定在coA磁珠上,对细胞进行透膜,加入一抗孵育,再加二抗,最后加入pA-Tn5,对染色体进行切割并加入文库接头,最后提取切割的DNA,并进行一定循环数的PCR扩增,构建文库.CUT&TAG与ChIP都是解释蛋白与DNA相互作用,可以说CUT&TAG是ChIP的优化版本。与ChIP相比,CUT&TAG具有众多优势。随后进行测序及分析。
与ChIP相比的技术优势:
CUT&TAG与ChIP都是解释蛋白与DNA相互作用,可以说CUT&TAG是ChIP的优化版本。与ChIP相比,CUT&TAG具有众多优势。
● 细胞量少:每个IP仅需要10000个细胞
● 测序量小:测序量小,只需测3,000,000-5,000,000个reads,不需要测Input
● 实验周期短:实验周期短,只需1-2天即可完成
● 实验过程无需交联:实验过程不需要交联,结果重复性更好